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晚期肺癌患者基因与临床动态数据
截止时间:2025-06-30 23:59:59
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需求截止时间
2025-06-30 23:59:59
1. 例数:
肺癌(TNM III-IV期):2000例。
2. 字段:
2.1 基因数据(重点需求)
患者从首次确诊至末次随访之间的基因检测原始数据(文件格式为FASTQ,要求使用2019年后主流平台,如Illumina NovaSeq 6000、DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000/DNBSEQ-G400及相关兼容平台)。
突变注释文件(VCF格式,含COSMIC、OncoKB数据库注释)。
2.2 临床数据
患者基本信息:
人口学数据:年龄、性别、种族、生活习惯、职业暴露、环境暴露。
病史记录:现病史、既往疾病、合并症、家族史、用药史、不良反应、ECOG评分。
诊断与病理数据:
肿瘤组织学类型(如腺癌、鳞癌、小细胞肺癌)、分化程度、分子分型(如EGFR突变型/ALK阳性/PD-L1高表达等)、免疫组化结果、TNM分期(原发肿瘤大小、淋巴结转移、远处转移)。
影像学与实验室数据:
影像学数据:首次诊断和治疗期间动态监测的影像学指标,包括且不限于胸透、CT、MRI、PET-CT图像等。
实验室数据:首次诊断和治疗期间动态监测的实验室指标,包括且不限于血常规、肝肾功能、肿瘤标志物(如CEA、CA19-9、CA125)等。
其他临床数据:首次诊断和治疗期间动态监测的其他临床相关指标。
治疗与响应数据(重点需求):
治疗方案:包括治疗线数、各线治疗方案、治疗类型(如化疗、靶向治疗、免疫治疗)、用药细节(药物名称、剂量、治疗周期)、联合/序贯治疗方案、治疗中断/终止原因。
应答评估:基于RECIST标准,提供治疗前后的影像学评估数据,并包括治疗相关的生物标志物数据。
随访与预后数据:
复发/转移情况:局部复发或远处转移的具体情况和发生时间。
生存状态:患者死亡时间、死亡原因(疾病相关或其他)。需提供全周期生存数据,包括治疗后随访信息。
3. 数据质量要求:
3.1 临床数据要求
字段完整性:每个病例必须包含关键字段(如TNM分期、基因突变类型、治疗记录),缺失率≤5%。
时间连续性:需覆盖患者从首次诊断到死亡/末次随访的全周期数据,特别关注治疗前后的动态变化。
数据更新周期:随访数据需在患者状态变更后3个月内更新(如复发、死亡)。
治疗记录规范:治疗方案需包括治疗线数、治疗类型、治疗药物名称、用药剂量、用药持续时间(如“奥沙利铂 85mg/m² d1, q2w”)以及治疗相关不良事件的分级及处理记录。
影像数据标准:需要提供原始DICOM文件,影像数据应包含层厚、原始参数、放射科结构化报告,CT/MRI的层厚≤3mm的影像占比不低于80%。
3.2 基因数据要求
样本质量控制:FFPE样本肿瘤细胞占比≥30%。
对照样本:需配套外周血白细胞测序数据,用于胚系变异识别,对照样本占比不低于40%。
测序深度:全基因组测序(WGS)≥30X,全外显子测序(WES)≥100X,靶向Panel测序≥500X。
数据格式:基因数据需提供原始格式(FASTQ)和注释后格式(VCF),遵循GA4GH规范。
突变注释:突变注释需基于权威数据库(如COSMIC、ClinVar),并标注置信度(VAF≥5%)。必须包含突变功能注释(如致病性、临床意义)、药物关联(OncoKB数据库分级)。
3.3 动态数据要求
所需数据包括从首次确诊到末次随访之间的全周期基因和临床数据。
3.4 数据来源多样性
单一中心数据占比≤40%。
肺癌(TNM III-IV期):2000例。
2. 字段:
2.1 基因数据(重点需求)
患者从首次确诊至末次随访之间的基因检测原始数据(文件格式为FASTQ,要求使用2019年后主流平台,如Illumina NovaSeq 6000、DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000/DNBSEQ-G400及相关兼容平台)。
突变注释文件(VCF格式,含COSMIC、OncoKB数据库注释)。
2.2 临床数据
患者基本信息:
人口学数据:年龄、性别、种族、生活习惯、职业暴露、环境暴露。
病史记录:现病史、既往疾病、合并症、家族史、用药史、不良反应、ECOG评分。
诊断与病理数据:
肿瘤组织学类型(如腺癌、鳞癌、小细胞肺癌)、分化程度、分子分型(如EGFR突变型/ALK阳性/PD-L1高表达等)、免疫组化结果、TNM分期(原发肿瘤大小、淋巴结转移、远处转移)。
影像学与实验室数据:
影像学数据:首次诊断和治疗期间动态监测的影像学指标,包括且不限于胸透、CT、MRI、PET-CT图像等。
实验室数据:首次诊断和治疗期间动态监测的实验室指标,包括且不限于血常规、肝肾功能、肿瘤标志物(如CEA、CA19-9、CA125)等。
其他临床数据:首次诊断和治疗期间动态监测的其他临床相关指标。
治疗与响应数据(重点需求):
治疗方案:包括治疗线数、各线治疗方案、治疗类型(如化疗、靶向治疗、免疫治疗)、用药细节(药物名称、剂量、治疗周期)、联合/序贯治疗方案、治疗中断/终止原因。
应答评估:基于RECIST标准,提供治疗前后的影像学评估数据,并包括治疗相关的生物标志物数据。
随访与预后数据:
复发/转移情况:局部复发或远处转移的具体情况和发生时间。
生存状态:患者死亡时间、死亡原因(疾病相关或其他)。需提供全周期生存数据,包括治疗后随访信息。
3. 数据质量要求:
3.1 临床数据要求
字段完整性:每个病例必须包含关键字段(如TNM分期、基因突变类型、治疗记录),缺失率≤5%。
时间连续性:需覆盖患者从首次诊断到死亡/末次随访的全周期数据,特别关注治疗前后的动态变化。
数据更新周期:随访数据需在患者状态变更后3个月内更新(如复发、死亡)。
治疗记录规范:治疗方案需包括治疗线数、治疗类型、治疗药物名称、用药剂量、用药持续时间(如“奥沙利铂 85mg/m² d1, q2w”)以及治疗相关不良事件的分级及处理记录。
影像数据标准:需要提供原始DICOM文件,影像数据应包含层厚、原始参数、放射科结构化报告,CT/MRI的层厚≤3mm的影像占比不低于80%。
3.2 基因数据要求
样本质量控制:FFPE样本肿瘤细胞占比≥30%。
对照样本:需配套外周血白细胞测序数据,用于胚系变异识别,对照样本占比不低于40%。
测序深度:全基因组测序(WGS)≥30X,全外显子测序(WES)≥100X,靶向Panel测序≥500X。
数据格式:基因数据需提供原始格式(FASTQ)和注释后格式(VCF),遵循GA4GH规范。
突变注释:突变注释需基于权威数据库(如COSMIC、ClinVar),并标注置信度(VAF≥5%)。必须包含突变功能注释(如致病性、临床意义)、药物关联(OncoKB数据库分级)。
3.3 动态数据要求
所需数据包括从首次确诊到末次随访之间的全周期基因和临床数据。
3.4 数据来源多样性
单一中心数据占比≤40%。
需求场景:通过整合基因数据、临床数据、治疗响应及生存期数据,支持人工智能模型的训练,以优化药物敏感性预测算法。